Nel 1923 un gruppo di appassionati fondò la Pro Cervignano, staccandosi dalla polisportiva "Pietro Zorutti". I dirigenti di allora, guidati da Giacomo Fogar, scelsero i colori sociali "giallo-blu", quelli della Città di Cervignano del Friuli.

Le prime gare si disputarono sul campo della "Zorutti" (nei pressi dell'incrocio delle Rotonde); solo qualche anno dopo alcuni volontari costruirono il nuovo campo che sorgeva nell'area dell'attuale campo sportivo di via del Zotto (il terreno però era disposto trasversalmente).

Nei primi anni la Pro Cervignano si distinse per la tenacia dei suoi atleti; nel 1927 si fuse con la "Zorutti" e partecipò ai campionati organizzati dall'O.N.D. (Organizzazione Nazionale Dopolavoro); nel 1932/33 vinse il suo primo titolo regionale.

Nel 1937 assunse la denominazione "A.C. Pro Cervignano" (Presidente Guido Picotti). Dopo il difficile periodo bellico, nel 1945 cambiò denominazione e divenne "U.C. Pro Cervignano" (Presidente Aldo Bertoni).

Nel 1946, con l'aiuto degli "Alleati", venne costruito l'attuale campo di via del Zotto. Negli anni successivi diede vita al "vivaio giovanile" che negli anni successivi si rivelò fondamentale per il proseguimento dell'attività.

Dopo un periodo difficile, sotto la presidenza di Duilio Rigonat, il sodalizio cervignanese riconquistò il vertice del calcio regionale, vincendo, nella seconda metà degli anni sessanta, per due volte il titolo regionale. Poi dopo qualche anno di difficoltà negli anni ottanta la Pro Cervignano fu di nuovo protagonista disputando anche il campionato interregionale.

Nel frattempo l'Amministrazione comunale costruì il nuovo campo sportivo di Piazzale Lancieri d'Aosta (recentemente dedicato alla memoria di Pierino Dissabo, per tanti anni il massaggiatore della squadra).

Il periodo positivo culminò all'inizio degli anni 90; una forte crisi però portò la società alla fusione con la Polisportiva Muscoli (da cui la nuova denominazione Pro Cervignano Muscoli) e, subito dopo,  ad essere retrocessa in seconda categoria, senza calciatori e con il settore giovanile completamente azzerato.

Dal 1996, sotto la guida del Presidente Sabatino Mansi, la squadra, passo dopo passo, ha riconquistato posizioni più importanti per culminare con la promozione in eccellenza avvenuta il 24 maggio 2009 sul campo della Tiezzese.

Va ricordato inoltre il completamento di tutte le squadre del settore giovanile e della scuola calcio.

Dopo due campionati in eccellenza il 19 maggio 2011 l'Assemblea dei Soci ha deliberato la nuova composizione societaria che prevede Sabatino Mansi presidente onorario e Roberto Gregoris nuovo presidente.

Palmares :

Campione regionale negli anni : 1932/33 - 1965/66 - 1969/70 - 1982/83 - 1984/85 - 1992/93

Presidenti :

Giacomo Fogar - Niccolò Fornasir - Mario Ferri - Antonio Fior - Guido Venier - Guido Picotti - Bruno Trombin - Aldo Bertoni - Guido Variola - Adelchi Salvador - Giovanni Gervasi - Giuseppe Puntin - Bruno Tonello - Innocente Martelli - Natalino Camuffo - Angelo Bradaschia - Duilio Rigonat - Ernesto Piani - Aldo Tomat - Giocondo Vrech - Luigi Lazzaris - Giuliano Gottard - Giorgio Zanmarchi - Sabatino Mansi - Roberto Gregoris